období záznamů: 1800–2024
Legenda:
ověřené záznamy
neověřené záznamy
nejisté záznamy
Červený seznam Šumavy: NT
Bodlák lopuchovitý se vyskytuje převážně v horských oblastech, odkud podél vodních toků sestupuje do nižších poloh. Nejčastěji roste na březích řek a potoků, na vlhkých opuštěných loukách, ale i v ruderální vegetaci na místech s dostatkem živin a vlhkosti (okolí lidských sídel, vzácně příkopy a okraje cest). Na Šumavě je poměrně hojný v jihovýchodní části, zejména podél Vltavy a jejích přítoků a v Želnavské hornatině, nejvíce k severozápadu a zároveň v nejvyšších nadmořských výškách okolo 1000 m leží lokality v okolí Knížecích Plání a Kvildy a ojedinělý výskyt byl zaznamenán u potoka Losenice u Karliny Pily (může jít o recentní zavlečení), dále k severozápadu druh na Šumavě neroste. V bavorské a rakouské části Šumavy bodlák lopuchovitý také téměř chybí, roste pouze u zaniklé osady Leopoldsreut (jižně od obce Philippsreut) a jižně od Bayerisch Eisenstein. Oba výskyty jsou však nepůvodní.