období záznamů: 1847–2024
Legenda:
ověřené záznamy
neověřené záznamy
nejisté záznamy
Červený seznam Šumavy: LC
Tento cirkumpolární druh s boreo-montánním rozšířením se na Šumavě vyskytuje roztroušeně ve všech vyšších polohách převážně nad 1000 m. Ojedinělé výskyty v nižších nadmořských výškách okolo 900 m nebo až 830 m (Javorná), představují výskyty v zařízlých údolích potoků. Papratka horská snáší vyšší zástin a roste zde typicky v horských smrčinách, acidofilních horských bučinách a v nivách potoků. Druh je však velmi dobře schopen existovat i na přímém oslunění např. v ledovcových karech. Výskyt ve vyšších polohách je bezesporu vázán na vyšší vzdušnou vlhkost těchto poloh. Papratka horská může místy, zejména v nivách potoků a ledovcových karech vytvářet i typické kompaktní porosty vysokobylinných kapradinových niv sv. Dryopterido-Athyrion distentifolii. Zdá se, že druh není v oblasti přímo ohrožen, a to ani změnami lesních kultur ani gradací kůrovcové kalamity.
Z bavorské strany Šumavy, např. na Velkého Javoru, je ojediněle uváděn kříženec obou druhů A. ×reichsteinii (Schneller & Rasbach 1984). Tento kříženec může vznikat na společných lokalitách rodičovských druhů a vyznačuje se intermediárním habitem a kompletně abortovanými výtrusy. Je pravděpodobné, že se na Šumavě vyskytuje na dalších společných lokalitách obou druhů a jeho hledání je tedy potřeba věnovat zvýšenou pozornost.
Nejvyšší výskyt: 1450 m n. m.